42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4435 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  849    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  72.6 
 
 
418 aa  614  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  72.12 
 
 
415 aa  608  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  58.17 
 
 
409 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  55.83 
 
 
410 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  35.82 
 
 
406 aa  253  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  33.84 
 
 
405 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  38.37 
 
 
410 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  33.59 
 
 
406 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  31.19 
 
 
411 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  30.15 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  31.99 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  33.33 
 
 
415 aa  180  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  32.5 
 
 
406 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  32.48 
 
 
455 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  33.66 
 
 
406 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  30.81 
 
 
406 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  31.2 
 
 
398 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  30.26 
 
 
410 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  30.26 
 
 
410 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  28.97 
 
 
403 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  32.67 
 
 
404 aa  163  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  30.51 
 
 
405 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  29.8 
 
 
421 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  30.79 
 
 
378 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  32 
 
 
405 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  30.23 
 
 
409 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  31.33 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  31 
 
 
405 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  31 
 
 
405 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  31 
 
 
405 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  31 
 
 
405 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  31 
 
 
405 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  31 
 
 
405 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  31 
 
 
405 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  32.25 
 
 
739 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  30.6 
 
 
398 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  29.51 
 
 
421 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  30.88 
 
 
407 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  24.75 
 
 
418 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  24.46 
 
 
384 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  29.2 
 
 
442 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>