42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3506 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  833    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  62.56 
 
 
410 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  58.17 
 
 
417 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  55.83 
 
 
418 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  55.58 
 
 
415 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  34.9 
 
 
406 aa  219  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  36.73 
 
 
406 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  32.49 
 
 
405 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  33.83 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  38.42 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  33 
 
 
446 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  33.75 
 
 
408 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  29.78 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  33.93 
 
 
415 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  32.42 
 
 
406 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  31.39 
 
 
421 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  28.18 
 
 
418 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  31.73 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  30.37 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  31.34 
 
 
406 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  29.32 
 
 
405 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  27.4 
 
 
405 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  27.19 
 
 
410 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  27.19 
 
 
410 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  29.93 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  30.17 
 
 
739 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  29.02 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  27.64 
 
 
455 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  28.12 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  27.45 
 
 
409 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  26.1 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  29.03 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  27.79 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  27.39 
 
 
402 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  28.17 
 
 
384 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  26.69 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>