43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0876 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  92.38 
 
 		 402 aa  759    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  839    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  78.96 
 
 		 404 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  73.63 
 
 		 410 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  73.63 
 
 		 410 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  73.63 
 
 		 405 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  66.33 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  66.33 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  66.33 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  66.08 
 
 		 405 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  66.08 
 
 		 405 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  66.08 
 
 		 405 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  66.08 
 
 		 405 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  64.82 
 
 		 405 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  63.48 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  61.27 
 
 		 406 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  56.61 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  53.69 
 
 		 739 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  52.11 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  55.67 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  42.4 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  43.47 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  43.63 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  42.79 
 
 		 410 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  40.66 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  40 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  42.58 
 
 		 415 aa  246  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  35.95 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  40.61 
 
 		 442 aa  222  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  32.92 
 
 		 446 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  34.32 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  37.95 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  34.69 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  31.2 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  35.51 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  33.58 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  32.91 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  29.88 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  29.34 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  29.27 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  27.79 
 
 		 409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  32.65 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01389  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 306 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>