42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2103 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  863    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  33.9 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  34.27 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  31.7 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  32.52 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  32.34 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  31.34 
 
 		 406 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  31.51 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  31.51 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  31.51 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  34.69 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  33.42 
 
 		 402 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  31.75 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  31.65 
 
 		 403 aa  169  9e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  30.85 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  30.67 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  31.7 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  29.8 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  30.64 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  30.64 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  30.64 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  30.64 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  30.64 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  30.64 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  30.64 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  29.9 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  28.18 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  30.19 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  29.68 
 
 		 409 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  29.38 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  28.23 
 
 		 739 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  25.44 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  25.19 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  29.95 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  25.69 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  25.82 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  31.5 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  29.66 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  26.42 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  24.75 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  28.28 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  26.12 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>