42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5856 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  797    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  79.6 
 
 		 398 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  61.64 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  61.64 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  61.64 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  61.38 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  61.38 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  61.38 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  61.38 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  61.22 
 
 		 405 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  61.52 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  59.15 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  56.03 
 
 		 410 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  56.03 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  56.03 
 
 		 410 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  56.86 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  57.83 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  55.73 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  55.16 
 
 		 739 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  54.91 
 
 		 409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  45.41 
 
 		 405 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  46.65 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  49.23 
 
 		 406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  47.04 
 
 		 410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  44.1 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  44.3 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  43.19 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  43.08 
 
 		 415 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  39.2 
 
 		 442 aa  248  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  41.77 
 
 		 421 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  39.8 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  44.19 
 
 		 378 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  34.58 
 
 		 406 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  32.75 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  32.08 
 
 		 418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  35.31 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  32.58 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  31.75 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  31.58 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  31.06 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  27.3 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  30.79 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>