42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3797 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  100 
 
 
415 aa  806    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  49.38 
 
 
406 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  44.14 
 
 
405 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  52.16 
 
 
406 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  50 
 
 
410 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  43.11 
 
 
411 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  42.14 
 
 
408 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  43.73 
 
 
406 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  40 
 
 
421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  42.43 
 
 
406 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  39.07 
 
 
405 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  39.07 
 
 
405 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  39.07 
 
 
405 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  39.07 
 
 
405 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  39.07 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  39.07 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  39.07 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  40.45 
 
 
403 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  39.31 
 
 
405 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  39.19 
 
 
409 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  43.12 
 
 
739 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  38.01 
 
 
404 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  39.45 
 
 
446 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  42.82 
 
 
398 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  41.57 
 
 
405 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  41.57 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  41.57 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  38.25 
 
 
402 aa  242  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  40.51 
 
 
398 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  43.57 
 
 
407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  38.64 
 
 
378 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  37.41 
 
 
421 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  34.19 
 
 
455 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  37.2 
 
 
406 aa  216  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  34.22 
 
 
442 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  32.24 
 
 
418 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  34.09 
 
 
409 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  31.54 
 
 
418 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  34.44 
 
 
410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  32.49 
 
 
415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  30.31 
 
 
384 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>