42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3414 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  832    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  92.38 
 
 
407 aa  759    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  79.5 
 
 
404 aa  631  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  74.62 
 
 
410 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  74.62 
 
 
410 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  74.62 
 
 
405 aa  610  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  66.41 
 
 
405 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  66.41 
 
 
405 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  66.41 
 
 
405 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  66.16 
 
 
405 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  66.16 
 
 
405 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  66.16 
 
 
405 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  66.16 
 
 
405 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  65.65 
 
 
405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  64.29 
 
 
409 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  61.36 
 
 
406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  53.62 
 
 
739 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  52.01 
 
 
406 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  57.58 
 
 
398 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  54.85 
 
 
398 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  42.47 
 
 
406 aa  312  4.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  42 
 
 
405 aa  312  6.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  45.2 
 
 
406 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  43.83 
 
 
410 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  41.43 
 
 
408 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  41.03 
 
 
411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  38.25 
 
 
415 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  36.06 
 
 
403 aa  239  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  41.6 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  34.91 
 
 
421 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  32.09 
 
 
446 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  32.17 
 
 
406 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  37.62 
 
 
378 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  33.5 
 
 
418 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  32.92 
 
 
455 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  34.07 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  31.08 
 
 
417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  29.85 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  29.6 
 
 
415 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  29.78 
 
 
410 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  27.39 
 
 
409 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  31.96 
 
 
384 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>