42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1402 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  820    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  56.68 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  54.14 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  54.14 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  58.65 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  54.14 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  53.88 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  53.88 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  53.88 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  53.88 
 
 		 405 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  51.37 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  51.89 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  51.37 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  53.63 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  52.01 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  52.11 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  51.28 
 
 		 409 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  55.73 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  51.37 
 
 		 739 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  55.3 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  44.83 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  45.2 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  47.38 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  45.41 
 
 		 410 aa  293  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  43.73 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  40.15 
 
 		 446 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  40.29 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  39.71 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  38.89 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  37.62 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  40.62 
 
 		 378 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  35.29 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  34.3 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  31.75 
 
 		 406 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  32.58 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  29.38 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  30.81 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  30.68 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  30.43 
 
 		 415 aa  152  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  31.28 
 
 		 410 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  29.02 
 
 		 409 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  28.5 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>