42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2110 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  933    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  38.64 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  36.32 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  35.21 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  37.91 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  37.31 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  34.19 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  36.99 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  30.42 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  32.49 
 
 		 406 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  37.01 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  32.66 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  32.66 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  32.66 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  32.66 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  33.42 
 
 		 421 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  32.91 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  32.91 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  32.91 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  32.51 
 
 		 409 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  32.75 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  32.56 
 
 		 417 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  32.92 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  32.09 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  31.8 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  31.8 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  31.8 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  33.58 
 
 		 407 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  32.87 
 
 		 739 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  32.58 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  35.15 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  31.53 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  29.97 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  32.25 
 
 		 398 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  29.92 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  29.92 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  29.69 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  25.44 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  28.02 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  30.73 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  28.68 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  26.62 
 
 		 384 aa  136  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>