42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3719 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3719  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  820    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0882  hypothetical protein  54.61 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.897719  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3989  hypothetical protein  56.22 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.138068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5788  hypothetical protein  53.85 
 
 
406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414935  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2773  hypothetical protein  51.23 
 
 
408 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018367  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2398  hypothetical protein  50.87 
 
 
411 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3797  protein of unknown function UPF0261  50 
 
 
415 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3528  hypothetical protein  46.98 
 
 
403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.91982  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1402  hypothetical protein  46.86 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0211  hypothetical protein  42.58 
 
 
410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4005  hypothetical protein  42.58 
 
 
410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0547  hypothetical protein  42.72 
 
 
405 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0884  hypothetical protein  44.28 
 
 
405 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1533  protein of unknown function UPF0261  44.06 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758  hypothetical protein  43.77 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0590  hypothetical protein  43.77 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0700  hypothetical protein  43.77 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1655  hypothetical protein  43.77 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0517  hypothetical protein  43.77 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2103  hypothetical protein  43.77 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2008  hypothetical protein  43.77 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.027486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3414  hypothetical protein  44.08 
 
 
402 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  46.38 
 
 
739 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5856  hypothetical protein  47.54 
 
 
398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2781  hypothetical protein  43.77 
 
 
406 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0876  hypothetical protein  43.49 
 
 
407 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3030  hypothetical protein  45.32 
 
 
404 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2269  hypothetical protein  43.21 
 
 
446 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139648 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4991  hypothetical protein  45.02 
 
 
398 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148886  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4740  hypothetical protein  43.25 
 
 
409 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1170  hypothetical protein  41.25 
 
 
421 aa  279  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7443  hypothetical protein  43.81 
 
 
378 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08931  UPF0261 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10120)  39.21 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.254707  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4435  hypothetical protein  38.37 
 
 
417 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00140504  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3506  hypothetical protein  38.42 
 
 
409 aa  250  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.352048  decreased coverage  0.0000728934 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1168  hypothetical protein  36.88 
 
 
418 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.589223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1071  hypothetical protein  36.88 
 
 
415 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147244  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3712  hypothetical protein  36.46 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0523031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2110  hypothetical protein  37.01 
 
 
455 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1862  hypothetical protein  34.72 
 
 
406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2103  hypothetical protein  30.67 
 
 
418 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1387  hypothetical protein  27.97 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205174  normal  0.10084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>