10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4405 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0597  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 55 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.41654  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5316  Flp/Fap pilin component  46.67 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351071  hitchhiker  0.000566754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  35.48 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  35.48 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  35.48 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  36.21 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  37.04 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>