43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4393 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  40 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  42.17 
 
 		 468 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  39.18 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  40.28 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  40.05 
 
 		 459 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  37.83 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  36.97 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  38.21 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  40.05 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  36.32 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  39.63 
 
 		 432 aa  299  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  39.29 
 
 		 436 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  39.29 
 
 		 436 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  39.41 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  38.6 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  36.4 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  36.69 
 
 		 538 aa  289  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  40.55 
 
 		 478 aa  289  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  37.53 
 
 		 538 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  36.63 
 
 		 536 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  36.45 
 
 		 538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  38.15 
 
 		 578 aa  282  7.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  38.36 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  35.1 
 
 		 519 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  37.02 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  36.69 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  35.51 
 
 		 499 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  36.45 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  34.84 
 
 		 466 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  37.24 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  31.7 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  34.93 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  34.93 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  34.92 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  34.58 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  33.57 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  33.17 
 
 		 437 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  32.54 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  32.54 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  32.54 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.46 
 
 		 748 aa  43.5  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>