More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1516 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2771  aldehyde dehydrogenase  99 
 
 		 498 aa  1010    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1516  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  100 
 
 		 498 aa  1018    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.394302 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2692  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  99.2 
 
 		 498 aa  1011    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  48.71 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.47 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.47 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.57 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.47 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.26 
 
 		 482 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.26 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.04 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.04 
 
 		 480 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.49 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.04 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.04 
 
 		 482 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.12 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.33 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.19 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.19 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.83 
 
 		 482 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.73 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.62 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  43.62 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.19 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.38 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.62 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.27 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.62 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.62 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.62 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  43.62 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.49 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.49 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.98 
 
 		 486 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.26 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 503 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  44.06 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.32 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.53 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.3 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.98 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.65 
 
 		 486 aa  379  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.44 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.22 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.54 
 
 		 490 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.15 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.34 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.16 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.8 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.15 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.12 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  44.63 
 
 		 497 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.95 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.95 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.09 
 
 		 484 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.98 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.95 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.95 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  44.31 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.15 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.95 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.01 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.59 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0912  Aldehyde Dehydrogenase  44.65 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.42 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.38 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.42 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.03 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.03 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.48 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.57 
 
 		 480 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.15 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.12 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>