117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1465 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1353  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1465  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2705  LuxR family transcriptional regulator  99 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306618  normal  0.0198743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1382  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  40 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  44.64 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  42.11 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  42.11 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 446 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 522 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.78 
 
 		 425 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.78 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.78 
 
 		 394 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  28.71 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3400  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 218 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 218 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  34.43 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0523  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335975  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  38.89 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4679  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 950 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4903  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.650668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4955  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04242  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00962372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3632  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000755622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  40 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  37.31 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4598  LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000019366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  37.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4959  LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  37.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3690  LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0223527  decreased coverage  0.00000764296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  37.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4911  LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000448955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  37.31 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4868  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 140 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.221718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  37.31 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5878  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04208  hypothetical protein  35.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0122864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0304  LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 282 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  40.35 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12543  Transcriptional regulator  34.55 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  40.82 
 
 		 508 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 206 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 219 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 247 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 226 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>