81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0093 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  99.73 
 
 		 371 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  100 
 
 		 371 aa  754    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  65.95 
 
 		 370 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  61.58 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  60.99 
 
 		 371 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  54.32 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  54.75 
 
 		 365 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  53.78 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  54.05 
 
 		 370 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  53.78 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  54.59 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  54.59 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  54.59 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  54.75 
 
 		 365 aa  418  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  53.51 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  53.78 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  54.32 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  54.32 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  55.91 
 
 		 360 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  49.86 
 
 		 371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  50 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  50.41 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  46.37 
 
 		 387 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  48.01 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  47.44 
 
 		 414 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  47.32 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  47.04 
 
 		 406 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  46.8 
 
 		 409 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  46.8 
 
 		 409 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  47.44 
 
 		 409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  44.44 
 
 		 392 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  46.65 
 
 		 493 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  45.45 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  44.94 
 
 		 514 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  44.94 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  44.66 
 
 		 520 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  45.4 
 
 		 506 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  45.4 
 
 		 506 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  43.82 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  41.36 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  40 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  38.68 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  40.28 
 
 		 403 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  38.29 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  36.99 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  32.11 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  29.39 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  33.49 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  29.35 
 
 		 393 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  33.78 
 
 		 468 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  33.77 
 
 		 367 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  33.78 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  31.71 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  36.67 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  33.11 
 
 		 421 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  31.14 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  25.87 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  30.34 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  33.11 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  26.61 
 
 		 384 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  35.76 
 
 		 348 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  30.99 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  28.46 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  31.02 
 
 		 612 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  33.94 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  29.02 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  30.73 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 1129 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 1140 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  30 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 1140 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 		 1140 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  28.86 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  27.31 
 
 		 460 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 477 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  24.77 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  27.85 
 
 		 609 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  24.23 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  24.01 
 
 		 1223 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  36.47 
 
 		 477 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>