62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1292 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  96.39 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  64.11 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.45 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.04 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.09 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.12 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.87 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.32 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  36.32 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.31 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.44 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.14 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.65 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.38 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.53 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.7 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.29 
 
 		 231 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.53 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.47 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.51 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.79 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.3 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.23 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.23 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.89 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.67 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.18 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.5 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.79 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.16 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  34.36 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  41.21 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0453  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  29.94 
 
 		 466 aa  48.5  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0825  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0324565 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  28.57 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  33.78 
 
 		 316 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1527  Serine/threonine protein kinase-like  24.84 
 
 		 672 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2868  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  32.69 
 
 		 520 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0240  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  25.9 
 
 		 527 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211158  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1273  metalloendopeptidase, glycoprotease family  29.13 
 
 		 557 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89641  predicted protein  31.46 
 
 		 546 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 526 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  30.43 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2225  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000380991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  46.67 
 
 		 571 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0267  hypothetical protein  48.89 
 
 		 961 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0262  hypothetical protein  48.89 
 
 		 961 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 		 571 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0924  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01930  conserved hypothetical protein  36.73 
 
 		 1169 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0805  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.444928  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  24.14 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 190 aa  42.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 338 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1948  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 		 209 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.33 
 
 		 445 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>