20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3287 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3287  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 273 aa  512  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3519  putative transmembrane anti-sigma factor  42.24 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.525401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0246  hypothetical protein  66.67 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1066  putative transmembrane anti-sigma factor  30.92 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1351  putative transmembrane anti-sigma factor  62.26 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1078  putative transmembrane anti-sigma factor  30.92 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.774518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1050  putative transmembrane anti-sigma factor  30.92 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5018  putative transmembrane anti-sigma factor  56.6 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10750  hypothetical protein  55.77 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00172003  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1677  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.397039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4445  putative transmembrane anti-sigma factor  57.38 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0521  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1084  putative transmembrane anti-sigma factor  54.17 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0936076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4387  hypothetical protein  31.03 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1801  hypothetical protein  47.44 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0680569  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5023  putative transmembrane anti-sigma factor  27.78 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  56.1 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5953  putative transmembrane anti-sigma factor  43.1 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  31.91 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5092  hypothetical protein  44.07 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>