More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2219 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01015  hypothetical protein similar to glycogen phosphorylase 1 (Broad)  47.2 
 
 
879 aa  709    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.202732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03269  maltodextrin phosphorylase  46.13 
 
 
797 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000198557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03280  glycogen phosphorylase  46.86 
 
 
815 aa  733    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0272942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0286  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.86 
 
 
815 aa  733    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0296  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.13 
 
 
797 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307375  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0519  glycogen phosphorylase  45.91 
 
 
813 aa  702    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7363  glycogen phosphorylase  48.58 
 
 
835 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221944  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2066  glycogen phosphorylase  49.15 
 
 
836 aa  772    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5041  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.65 
 
 
816 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17881  phosphorylase  49.06 
 
 
854 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.441746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2411  glycogen phosphorylase  45.51 
 
 
817 aa  650    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.141999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0067  glycogen phosphorylase  51.64 
 
 
832 aa  788    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2540  glycogen phosphorylase  53.37 
 
 
836 aa  780    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.461812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5024  glycogen phosphorylase  44.49 
 
 
802 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1798  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.74 
 
 
828 aa  739    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.362346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1496  glycogen phosphorylase family protein  48.06 
 
 
837 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5165  glycogen phosphorylase  45.67 
 
 
816 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4757  glycogen phosphorylase  44.24 
 
 
802 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4595  glycogen phosphorylase  44.36 
 
 
802 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4617  glycogen phosphorylase  44.36 
 
 
802 aa  641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.706651  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03530  glycogen phosphorylase, putative  46.74 
 
 
928 aa  653    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0374  phosphorylase  45.97 
 
 
816 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3854  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.09 
 
 
829 aa  823    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1176  phosphorylase  49.69 
 
 
839 aa  742    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4232  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  55.33 
 
 
848 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2056  phosphorylase  53.44 
 
 
837 aa  790    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1204  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.25 
 
 
831 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18101  phosphorylase  48.56 
 
 
854 aa  749    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4915  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.9 
 
 
816 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.570439  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2115  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.09 
 
 
833 aa  730    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0349  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.35 
 
 
816 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2887  glycogen phosphorylase  46.21 
 
 
801 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2661  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.21 
 
 
837 aa  828    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0182  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.59 
 
 
840 aa  752    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0152  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.31 
 
 
840 aa  747    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0940  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.59 
 
 
838 aa  778    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2767  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.68 
 
 
835 aa  806    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1132  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.46 
 
 
801 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3164  glycogen phosphorylase  47.32 
 
 
812 aa  697    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3088  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.38 
 
 
823 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0513  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  49.05 
 
 
833 aa  733    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000569061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5119  glycogen phosphorylase  44.24 
 
 
802 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1693  phosphorylase  48.19 
 
 
848 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  52.53 
 
 
844 aa  820    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.79007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2244  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  50.83 
 
 
826 aa  783    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1333  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.17 
 
 
843 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0130  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.15 
 
 
838 aa  730    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0864  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.83 
 
 
841 aa  794    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14998  predicted protein  44.58 
 
 
820 aa  677    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0844  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.13 
 
 
836 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1659  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.59 
 
 
807 aa  693    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72279  Releases glucose-1-phosphate from glycogen  43.99 
 
 
896 aa  691    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3118  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.86 
 
 
793 aa  705    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986953  normal  0.22362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0511  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.45 
 
 
815 aa  744    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17931  phosphorylase  48.56 
 
 
848 aa  748    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0989  phosphorylase  49.26 
 
 
816 aa  734    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4861  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.9 
 
 
838 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0879  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.01 
 
 
846 aa  811    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400969  normal  0.0261229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1023  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  51.01 
 
 
846 aa  811    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2201  phosphorylase  49.5 
 
 
817 aa  789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.511282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0952  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.96 
 
 
838 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1460  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.67 
 
 
831 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0820  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.57 
 
 
842 aa  685    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3051  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.41 
 
 
894 aa  691    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.501405  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2288  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.23 
 
 
823 aa  690    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.359184  hitchhiker  0.000599882 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1533  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.21 
 
 
801 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.732219  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2197  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.64 
 
 
831 aa  744    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5144  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  54.13 
 
 
827 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117324  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1323  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.29 
 
 
843 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0083  glycogen phosphorylase  43.65 
 
 
811 aa  646    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3500  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  43.49 
 
 
802 aa  638    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0885  glycogen phosphorylase  45.68 
 
 
819 aa  737    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0218  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  51.81 
 
 
850 aa  833    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.372597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3694  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.8 
 
 
849 aa  813    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2756  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.16 
 
 
837 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2834  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.03 
 
 
837 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2163  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.81 
 
 
838 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36840  glycogen phosphorylase  47.32 
 
 
812 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2739  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  46.43 
 
 
821 aa  712    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3830  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.4 
 
 
797 aa  673    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1170  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.65 
 
 
836 aa  704    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1105  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.06 
 
 
808 aa  779    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1470  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  53.43 
 
 
832 aa  819    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0341159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2957  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  53.09 
 
 
838 aa  813    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.815892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1520  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  46.31 
 
 
829 aa  769    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0549278  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3435  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.69 
 
 
824 aa  706    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.912321  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2932  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  49.29 
 
 
837 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3836  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.04 
 
 
815 aa  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.404476  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0415  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  51.85 
 
 
833 aa  807    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2240  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  50.31 
 
 
829 aa  783    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0942697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0119  maltodextrin phosphorylase  49.14 
 
 
817 aa  775    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4429  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  47.84 
 
 
798 aa  702    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44172  predicted protein  44.72 
 
 
876 aa  706    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.079411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2451  phosphorylase  49.75 
 
 
824 aa  720    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1705  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  48.67 
 
 
834 aa  780    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0880  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  45.81 
 
 
834 aa  710    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151922  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1192  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylases  52.01 
 
 
840 aa  818    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.823471  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1250  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  47.94 
 
 
842 aa  718    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25951  phosphorylase  49.5 
 
 
841 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20511  phosphorylase  49.69 
 
 
839 aa  741    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.694663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>