More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4695 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  68.67 
 
 
311 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  68.33 
 
 
311 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  66.45 
 
 
301 aa  407  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  67.33 
 
 
316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  66.11 
 
 
301 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  65.77 
 
 
299 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  65.45 
 
 
301 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  64.45 
 
 
301 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  64.98 
 
 
297 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  68.01 
 
 
297 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  64.78 
 
 
308 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  62 
 
 
302 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  64.55 
 
 
298 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  59.87 
 
 
306 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  60.2 
 
 
306 aa  358  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  59.41 
 
 
301 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  58.67 
 
 
299 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  54.88 
 
 
299 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 
296 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.31 
 
 
298 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  48.34 
 
 
302 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  47.02 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  46.51 
 
 
302 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47 
 
 
305 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  47.18 
 
 
302 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  44.08 
 
 
298 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  44.08 
 
 
298 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  44.08 
 
 
298 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  45.21 
 
 
298 aa  248  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  43.93 
 
 
302 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  42.38 
 
 
302 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  29.59 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.35 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
469 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  27.62 
 
 
461 aa  79.7  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.4 
 
 
610 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  26.69 
 
 
553 aa  75.5  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.58 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.6 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  30.73 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.89 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  36.28 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  35.71 
 
 
608 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
611 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  26.24 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1801  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38.66 
 
 
611 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  26.24 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  28.73 
 
 
468 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  29.67 
 
 
478 aa  72.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
471 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  36.67 
 
 
609 aa  72.8  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
471 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  26.15 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
609 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  27.68 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  31.11 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0535  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  32.31 
 
 
606 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.241436  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  27.69 
 
 
612 aa  71.2  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  25.73 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1377  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.96 
 
 
610 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.986235  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13473  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.03 
 
 
624 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0148882  hitchhiker  0.00269614 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  41.24 
 
 
607 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.68 
 
 
611 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2489  amidophosphoribosyltransferase  34.73 
 
 
502 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
614 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
610 aa  70.1  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  29.58 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
609 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.23 
 
 
610 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.23 
 
 
610 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0106  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  34.4 
 
 
604 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0427631  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2407  amidophosphoribosyltransferase  28.65 
 
 
487 aa  69.3  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.848054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>