61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3951 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  73.19 
 
 
264 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  72.22 
 
 
261 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  68.57 
 
 
339 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  62.18 
 
 
276 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  65.11 
 
 
262 aa  265  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  67.66 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  59.36 
 
 
275 aa  221  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  46.46 
 
 
265 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  48.15 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  48.15 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  69.17 
 
 
662 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  64.47 
 
 
211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  39.24 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  44.79 
 
 
108 aa  89  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  31.89 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  31.18 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  29.8 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  34.85 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.05 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.21 
 
 
2798 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  28.64 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.17 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.17 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.17 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.17 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.17 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  32.17 
 
 
121 aa  49.3  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.76 
 
 
260 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  29.31 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  31.43 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  25.93 
 
 
260 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.78 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  31.03 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  33.64 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  31.07 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  26.09 
 
 
123 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  28.05 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  27.64 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  31.63 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  31.49 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  26.85 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  30.7 
 
 
121 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  28.27 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  28.95 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  35.58 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  30.12 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  26.8 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  32.5 
 
 
254 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  28.8 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  29.2 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  29.2 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  31.49 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  27.33 
 
 
254 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  29.2 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  34.07 
 
 
243 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  27.22 
 
 
258 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  29.23 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>