More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2336 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 466 aa  945    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  45.01 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  44.92 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  45.1 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  44.79 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  43.76 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  44.79 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  43.76 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  44.35 
 
 		 460 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  44.42 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  44.65 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  44.42 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  44.42 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  44.87 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  44.65 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  44.55 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  44.19 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  44.87 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  44.19 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  43.96 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  43.15 
 
 		 444 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  42.44 
 
 		 455 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  41.8 
 
 		 461 aa  349  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  42.61 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  39.43 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  42.33 
 
 		 453 aa  342  7e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  44.27 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  46.45 
 
 		 456 aa  339  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  40.76 
 
 		 472 aa  332  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  43.91 
 
 		 450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  39.47 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  39.47 
 
 		 472 aa  325  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  40.58 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  39.47 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  39.47 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  39.47 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  39.47 
 
 		 472 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  39.47 
 
 		 472 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  39.47 
 
 		 472 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  40.68 
 
 		 463 aa  322  8e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  38.53 
 
 		 472 aa  322  8e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  41.81 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  39.05 
 
 		 468 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  38.83 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  40.49 
 
 		 459 aa  312  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  39.78 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  39.55 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  39.11 
 
 		 455 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  43.35 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  41.65 
 
 		 445 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  41.65 
 
 		 445 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  40.33 
 
 		 439 aa  305  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  41.33 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  41.65 
 
 		 445 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  41.32 
 
 		 454 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  38.98 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  39.11 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  40.66 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  40.67 
 
 		 471 aa  299  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  40.5 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  40.27 
 
 		 459 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  40.05 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  39.45 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  40.05 
 
 		 454 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  40.68 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  37.93 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  35.63 
 
 		 465 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  39.72 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  36.98 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  39.25 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  39.25 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  38.22 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  37.56 
 
 		 448 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  35.84 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  38.41 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  35.62 
 
 		 476 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  37.33 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  38.07 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  36.22 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  35.84 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  36.14 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  36.14 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  36.14 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 452 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  33.33 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  34.47 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  33.48 
 
 		 456 aa  236  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  33.48 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  33.48 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  33.48 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  33.63 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  33.63 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  33.48 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  34.83 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  35.48 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  34.34 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  35.16 
 
 		 475 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  35.84 
 
 		 461 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>