More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1571 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  75.24 
 
 		 729 aa  1132    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 728 aa  1477    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  65.19 
 
 		 726 aa  934    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  75.1 
 
 		 729 aa  1127    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  53.92 
 
 		 727 aa  799    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  63.12 
 
 		 724 aa  917    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  64.28 
 
 		 726 aa  939    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0582  dehydrogenase E1 component  77.53 
 
 		 714 aa  1112    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  34.86 
 
 		 675 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  29.91 
 
 		 791 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  33.48 
 
 		 669 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  34.44 
 
 		 680 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  30.03 
 
 		 823 aa  265  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  29.23 
 
 		 659 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  33.79 
 
 		 710 aa  259  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  30.37 
 
 		 657 aa  256  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  28.8 
 
 		 658 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  28.89 
 
 		 659 aa  247  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  31.89 
 
 		 666 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  29.03 
 
 		 659 aa  243  9e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  29.28 
 
 		 668 aa  234  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  31.82 
 
 		 736 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  31.01 
 
 		 702 aa  224  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  29.92 
 
 		 678 aa  219  1e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4117  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.43 
 
 		 345 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2033  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.13 
 
 		 328 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2363  dehydrogenase E1 component  40.51 
 
 		 332 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.706778  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  30.16 
 
 		 617 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  38.48 
 
 		 328 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0029  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  35.92 
 
 		 320 aa  209  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3772  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  35.92 
 
 		 320 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.514041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3050  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  37.72 
 
 		 332 aa  208  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  39.82 
 
 		 328 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  37.88 
 
 		 328 aa  204  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  38.15 
 
 		 327 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  38.15 
 
 		 327 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  38.84 
 
 		 328 aa  201  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1908  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  37.5 
 
 		 381 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  40.32 
 
 		 327 aa  200  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1630  dehydrogenase, E1 component  37.54 
 
 		 360 aa  200  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0754823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  41.47 
 
 		 324 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  38.27 
 
 		 324 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  38.18 
 
 		 325 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1036  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, alpha subunit  37.81 
 
 		 323 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0124954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3019  dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunits  30.42 
 
 		 652 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  39.03 
 
 		 330 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2059  dehydrogenase E1 component  37.22 
 
 		 346 aa  198  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2825  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  38.12 
 
 		 332 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2578  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.4 
 
 		 332 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000958625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  37.54 
 
 		 327 aa  197  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  37.99 
 
 		 332 aa  197  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  37.2 
 
 		 327 aa  196  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2804  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.81 
 
 		 332 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2539  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  39.07 
 
 		 332 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1224  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.15 
 
 		 376 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42946  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1505  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  39.03 
 
 		 345 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2588  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  39.07 
 
 		 332 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2505  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  39.07 
 
 		 332 aa  196  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2780  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  39.07 
 
 		 332 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0316753 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2776  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  39.07 
 
 		 332 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1603  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.54 
 
 		 348 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  38.85 
 
 		 467 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1218  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  34.41 
 
 		 322 aa  195  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0171  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  36.71 
 
 		 331 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4083  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  41.64 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.273828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  35.06 
 
 		 328 aa  195  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  37.76 
 
 		 328 aa  195  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0416  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase alpha subunit  37.91 
 
 		 326 aa  194  4e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  38.85 
 
 		 469 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  40.47 
 
 		 324 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  40.47 
 
 		 324 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  40.13 
 
 		 324 aa  194  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  38.46 
 
 		 328 aa  194  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0878  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, alpha subunit  37.3 
 
 		 322 aa  193  9e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00306772  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5154  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.82 
 
 		 360 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  37.34 
 
 		 326 aa  193  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  37.34 
 
 		 326 aa  193  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1796  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  36.89 
 
 		 348 aa  193  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281194  hitchhiker  0.0011937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  39.08 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  36.7 
 
 		 324 aa  192  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  38.54 
 
 		 465 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  38.73 
 
 		 327 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1415  dehydrogenase, E1 component  38.19 
 
 		 346 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  36.92 
 
 		 327 aa  192  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  38.66 
 
 		 327 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  38.46 
 
 		 326 aa  191  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0525  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  39 
 
 		 356 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2230  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.6 
 
 		 346 aa  191  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.753771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  39.37 
 
 		 326 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  39.12 
 
 		 343 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  36.98 
 
 		 351 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2909  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.54 
 
 		 349 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  38.7 
 
 		 320 aa  188  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  27.95 
 
 		 709 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0347  transketolase, central region  36.58 
 
 		 334 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0988  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.03 
 
 		 361 aa  187  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0916856  normal  0.876159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6515  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.51 
 
 		 346 aa  187  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1818  dehydrogenase, E1 component  36.86 
 
 		 342 aa  187  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0654  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  37.46 
 
 		 327 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1881  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  37.72 
 
 		 336 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>