More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1377 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  64.78 
 
 
559 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  64.96 
 
 
550 aa  709    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  63.49 
 
 
559 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  67.15 
 
 
583 aa  735    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  64.78 
 
 
550 aa  707    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  64.18 
 
 
560 aa  685    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  64.91 
 
 
559 aa  707    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  69.51 
 
 
585 aa  751    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  59.53 
 
 
573 aa  643    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  64.55 
 
 
554 aa  711    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  69.15 
 
 
587 aa  750    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  69.08 
 
 
585 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  67.33 
 
 
583 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  62.41 
 
 
559 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  62.9 
 
 
572 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  67.33 
 
 
557 aa  755    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  70.89 
 
 
587 aa  770    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  68.12 
 
 
576 aa  757    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  100 
 
 
569 aa  1152    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  57.01 
 
 
560 aa  642    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  55.64 
 
 
552 aa  607  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  59.49 
 
 
583 aa  588  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  56.8 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  56.57 
 
 
553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  56.99 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  56.43 
 
 
554 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  52.26 
 
 
556 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  53.19 
 
 
552 aa  551  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0601  NAD synthetase  53.65 
 
 
557 aa  551  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2943  NAD synthetase  55.08 
 
 
556 aa  544  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  53.99 
 
 
558 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  50 
 
 
556 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  47.43 
 
 
538 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.91 
 
 
543 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  47.34 
 
 
540 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  47.45 
 
 
539 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  47.45 
 
 
539 aa  485  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  49.28 
 
 
542 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  45.74 
 
 
545 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  44.81 
 
 
552 aa  480  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  50.18 
 
 
554 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  50.18 
 
 
559 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  47.52 
 
 
540 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  47.34 
 
 
540 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  47.52 
 
 
540 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  50.18 
 
 
554 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  43.22 
 
 
567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  51.19 
 
 
549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  49.91 
 
 
546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  51.19 
 
 
549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  49.2 
 
 
552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  48.56 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  49.19 
 
 
550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  49.27 
 
 
539 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  47.69 
 
 
564 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  47.16 
 
 
540 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  43.82 
 
 
567 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  47.97 
 
 
566 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  47.64 
 
 
562 aa  465  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  46.65 
 
 
545 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  47.82 
 
 
609 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  47.97 
 
 
566 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  47.82 
 
 
609 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  47.95 
 
 
546 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  47.31 
 
 
576 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.71 
 
 
537 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  47.8 
 
 
566 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  47.8 
 
 
566 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  47.8 
 
 
566 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  46.95 
 
 
572 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  46.75 
 
 
568 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  47.78 
 
 
566 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  47.44 
 
 
561 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  46.43 
 
 
572 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  47.66 
 
 
576 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  46.43 
 
 
572 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  47.32 
 
 
545 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  46.15 
 
 
565 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  46.17 
 
 
544 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.45 
 
 
535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  46.89 
 
 
562 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  47.83 
 
 
547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  48.08 
 
 
541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  44.59 
 
 
542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  47.46 
 
 
564 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  45.17 
 
 
538 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  48.58 
 
 
561 aa  452  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  44.4 
 
 
542 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  46.21 
 
 
566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  46.96 
 
 
545 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  48.98 
 
 
538 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  46.29 
 
 
577 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  45.96 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  45.64 
 
 
577 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  45.45 
 
 
545 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  45.45 
 
 
545 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.35 
 
 
559 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  42.66 
 
 
566 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  41.7 
 
 
573 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  42.11 
 
 
536 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>