More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2278 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  67.09 
 
 		 554 aa  754    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0601  NAD synthetase  70.11 
 
 		 557 aa  789    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  58.08 
 
 		 554 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  64.55 
 
 		 552 aa  728    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  100 
 
 		 553 aa  1140    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  64.44 
 
 		 556 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  67.45 
 
 		 554 aa  756    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  66.3 
 
 		 554 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  55.91 
 
 		 583 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  56.02 
 
 		 550 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  55.9 
 
 		 576 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  55.84 
 
 		 550 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  55.91 
 
 		 583 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  56.12 
 
 		 585 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  55.25 
 
 		 559 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  54.93 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  54.55 
 
 		 559 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  54.97 
 
 		 587 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  55.04 
 
 		 587 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  55.01 
 
 		 557 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  56.57 
 
 		 569 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  54.83 
 
 		 560 aa  588  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  55.4 
 
 		 585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  54.35 
 
 		 559 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  55.08 
 
 		 572 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  53.6 
 
 		 573 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  50.36 
 
 		 560 aa  566  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  51.74 
 
 		 583 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  48.55 
 
 		 552 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  50 
 
 		 558 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  46.94 
 
 		 554 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2943  NAD synthetase  48.92 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  45.37 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  46.88 
 
 		 542 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  46.94 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.52 
 
 		 537 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  44.79 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  44.73 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  45.08 
 
 		 564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  43.41 
 
 		 538 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  46.65 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  46.46 
 
 		 550 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  45.06 
 
 		 552 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  46.65 
 
 		 609 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  46.65 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  46.65 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  46.65 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  46.18 
 
 		 561 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  46.95 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  46.65 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  46.65 
 
 		 609 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  44.27 
 
 		 562 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  45.16 
 
 		 576 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  43.9 
 
 		 566 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  45.05 
 
 		 546 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  46.14 
 
 		 568 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  46.81 
 
 		 566 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  45.64 
 
 		 572 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  45.16 
 
 		 576 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  44.15 
 
 		 565 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.75 
 
 		 535 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.14 
 
 		 543 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  45.47 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  44.52 
 
 		 545 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  45.47 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  44.14 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  46.34 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  44.84 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  44.69 
 
 		 540 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  44.69 
 
 		 540 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  42.65 
 
 		 545 aa  428  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  44.46 
 
 		 546 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  44.44 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  44.34 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  46.34 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  44.51 
 
 		 540 aa  425  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  42.7 
 
 		 552 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  43.72 
 
 		 547 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  42.31 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  44.32 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  43.53 
 
 		 561 aa  422  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  42.73 
 
 		 538 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  42.26 
 
 		 567 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  43.59 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  43.76 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  41.62 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  42.23 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  43.04 
 
 		 545 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  43.42 
 
 		 545 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  42.73 
 
 		 541 aa  412  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  44.17 
 
 		 577 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.7 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  44.23 
 
 		 577 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  43.36 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  39.66 
 
 		 576 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  41.44 
 
 		 542 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  39.18 
 
 		 583 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  38.75 
 
 		 575 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  41.25 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  43.06 
 
 		 548 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>