More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2943 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  69.31 
 
 		 573 aa  773    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2943  NAD synthetase  100 
 
 		 556 aa  1130    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  56.99 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  56.83 
 
 		 576 aa  597  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  55.76 
 
 		 583 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  56.94 
 
 		 587 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  55.25 
 
 		 559 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  56.47 
 
 		 559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  56.58 
 
 		 585 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  56.1 
 
 		 559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  56.19 
 
 		 558 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  55.14 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  55.83 
 
 		 587 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  53.45 
 
 		 550 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  55.69 
 
 		 585 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  55.08 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  53.85 
 
 		 552 aa  566  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  53.27 
 
 		 550 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  54.91 
 
 		 557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  53.16 
 
 		 559 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  54.68 
 
 		 583 aa  558  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  56.4 
 
 		 583 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  53.25 
 
 		 572 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  49.09 
 
 		 560 aa  532  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  50.81 
 
 		 552 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  50.35 
 
 		 556 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  51.54 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  51.18 
 
 		 554 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  45.5 
 
 		 545 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.47 
 
 		 543 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  45.34 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  45.34 
 
 		 567 aa  477  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  47.41 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  47.31 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  42.5 
 
 		 545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  47.31 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0601  NAD synthetase  50.81 
 
 		 557 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  48.75 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  48.92 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  46.99 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  46.99 
 
 		 540 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  47.18 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  47.54 
 
 		 540 aa  465  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  45.64 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  44.66 
 
 		 540 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  48.82 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  47.09 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  43.74 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  46.65 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  45.65 
 
 		 564 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  46.63 
 
 		 561 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  48.11 
 
 		 550 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  44.06 
 
 		 539 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  48.47 
 
 		 559 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  45.96 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  44.78 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  43.69 
 
 		 554 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  43.06 
 
 		 542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  44.53 
 
 		 538 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  45.38 
 
 		 562 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  45.72 
 
 		 572 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  42.88 
 
 		 542 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  45.79 
 
 		 565 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  44.01 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.63 
 
 		 537 aa  442  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  45.34 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  43.92 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  45.55 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  45.55 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  45.47 
 
 		 566 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  44.54 
 
 		 576 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  45.55 
 
 		 561 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  44.58 
 
 		 562 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  46.06 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  46.07 
 
 		 547 aa  435  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  44.54 
 
 		 546 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  43.04 
 
 		 538 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  44.02 
 
 		 576 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  44.97 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  44.8 
 
 		 609 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  44.8 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  44.8 
 
 		 609 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  44.8 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  44.8 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  44.97 
 
 		 566 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.26 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.96 
 
 		 535 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  45.83 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  45.47 
 
 		 549 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  45.47 
 
 		 549 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  44.74 
 
 		 545 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  44.17 
 
 		 541 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  44.39 
 
 		 545 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  42.81 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.17 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  44.03 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  43.07 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  35.53 
 
 		 574 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  40.21 
 
 		 576 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  43.58 
 
 		 545 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>