More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0601 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1593  NAD synthetase  70.76 
 
 		 554 aa  792    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.635718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  71.09 
 
 		 554 aa  790    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  65.82 
 
 		 552 aa  732    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  70.11 
 
 		 553 aa  797    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1008  NAD synthetase  71.27 
 
 		 554 aa  791    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  66.43 
 
 		 556 aa  761    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0601  NAD synthetase  100 
 
 		 557 aa  1143    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  57.43 
 
 		 554 aa  626  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  55.5 
 
 		 583 aa  598  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  54.15 
 
 		 576 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  53.8 
 
 		 559 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  54.5 
 
 		 587 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  55.32 
 
 		 583 aa  581  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  53.1 
 
 		 559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  52.37 
 
 		 550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  52.9 
 
 		 559 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  54.05 
 
 		 585 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  52.19 
 
 		 550 aa  570  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  53.01 
 
 		 560 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  53.91 
 
 		 585 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  53.65 
 
 		 569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  53.53 
 
 		 587 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  51.26 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  51.09 
 
 		 559 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0970  NAD synthetase  52.16 
 
 		 573 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  52.05 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  46.84 
 
 		 560 aa  527  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  51.19 
 
 		 583 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  49.09 
 
 		 552 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0687  NAD synthetase  48.65 
 
 		 558 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.776924  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2943  NAD synthetase  50.81 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  44.42 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  44.78 
 
 		 552 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  46.22 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  43.54 
 
 		 564 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  44.06 
 
 		 539 aa  450  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  46.22 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.97 
 
 		 537 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  44.85 
 
 		 542 aa  438  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  44.1 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  42.86 
 
 		 538 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  45.61 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.83 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  43.84 
 
 		 546 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  45.05 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  42.98 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  44.96 
 
 		 559 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  42.46 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  44.42 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  45.11 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  42.71 
 
 		 561 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  44.42 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  44.24 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  45.11 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  42.61 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  42 
 
 		 538 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  43.13 
 
 		 562 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  41.53 
 
 		 567 aa  420  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  41.33 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  43.22 
 
 		 540 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  41.71 
 
 		 567 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  42.22 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  42.63 
 
 		 576 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  41.97 
 
 		 572 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  43.84 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  42.63 
 
 		 566 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  42.86 
 
 		 566 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  42.63 
 
 		 566 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  41.58 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  41.13 
 
 		 545 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  42.63 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  42.63 
 
 		 566 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  42.31 
 
 		 540 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  41.42 
 
 		 562 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  42.86 
 
 		 609 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  41.8 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  43.42 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  41.8 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  42.04 
 
 		 544 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  42.81 
 
 		 566 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  42.86 
 
 		 566 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  41.13 
 
 		 545 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  42.31 
 
 		 565 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  42.86 
 
 		 609 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  40.88 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  40.65 
 
 		 545 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.67 
 
 		 543 aa  412  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  42.07 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  42.11 
 
 		 545 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  42.37 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  41.64 
 
 		 542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  41.82 
 
 		 542 aa  409  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  42.37 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  41.74 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  40.6 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  42.49 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  40.6 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  44.04 
 
 		 538 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.6 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  41.85 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>