67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0285 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
352 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  50.76 
 
 
333 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  47.48 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 
330 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 
330 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  47.73 
 
 
330 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  49.84 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  46.5 
 
 
331 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  44.83 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 
338 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  42.47 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  39.54 
 
 
333 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  37.73 
 
 
335 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  43.91 
 
 
318 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  40.34 
 
 
379 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 
347 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  36.54 
 
 
375 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
348 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  40.07 
 
 
311 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 
333 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  35.51 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  30.7 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  36.22 
 
 
302 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  23.72 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  24.24 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  23.53 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  23.21 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 
528 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  25.09 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  25.45 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  23.4 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  23.57 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  24.06 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  23.02 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  23.02 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  23.02 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  22.73 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  21.43 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  24.63 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  22.22 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  23.88 
 
 
323 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
327 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  22.64 
 
 
323 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  28.8 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  23.4 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  24.65 
 
 
323 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  23.72 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1456  serine/threonine protein kinase  23.63 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  26.22 
 
 
326 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  22.95 
 
 
976 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  23.16 
 
 
973 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  28.27 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  25.88 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  24.04 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  28.27 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  28.52 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  22.01 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  21.63 
 
 
970 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  27.03 
 
 
319 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  22.37 
 
 
349 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>