42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2952 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  669    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  49.23 
 
 
323 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  31.08 
 
 
323 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  31.05 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  30.86 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  31.08 
 
 
323 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  30.71 
 
 
323 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  30.71 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  30.71 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  31.47 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  30.38 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  29.41 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  25.66 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  25.66 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  25.28 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  27.03 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  23.95 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  26.07 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  27.6 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  24.91 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  24.81 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  23.03 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  24.03 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  21.43 
 
 
337 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  24.42 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  23.47 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  24.33 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  26.22 
 
 
352 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  21.64 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  22.22 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  25.57 
 
 
322 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
347 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  25.19 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  26.9 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  25.19 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  22.78 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 
375 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  24.64 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  22.81 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  21.24 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 
348 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  26.11 
 
 
341 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>