More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3682 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3682  helicase domain-containing protein  100 
 
 
629 aa  1258    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0389  RecG-like helicase  36.9 
 
 
636 aa  259  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0493519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.5 
 
 
729 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.09 
 
 
679 aa  203  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2813  helicase domain protein  36.69 
 
 
653 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.208739  normal  0.570688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.66 
 
 
729 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.66 
 
 
729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.4 
 
 
672 aa  198  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.64 
 
 
750 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0594  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.1 
 
 
686 aa  194  4e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.17 
 
 
671 aa  194  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 
704 aa  193  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.99 
 
 
772 aa  193  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.86 
 
 
704 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.97 
 
 
767 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.11 
 
 
765 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.74 
 
 
772 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.54 
 
 
815 aa  190  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.17 
 
 
700 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.92 
 
 
675 aa  189  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.93 
 
 
778 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.08 
 
 
678 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.99 
 
 
904 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.71 
 
 
697 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.95 
 
 
818 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.91 
 
 
697 aa  186  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.93 
 
 
779 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.96 
 
 
691 aa  186  9e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.18 
 
 
690 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.67 
 
 
753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.65 
 
 
681 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.99 
 
 
904 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.14 
 
 
829 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1212  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.78 
 
 
699 aa  185  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.376481  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.91 
 
 
701 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.65 
 
 
702 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.55 
 
 
731 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.65 
 
 
703 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.9 
 
 
772 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.14 
 
 
693 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.14 
 
 
693 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4215  helicase domain-containing protein  30.89 
 
 
664 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00111168  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.05 
 
 
689 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.15 
 
 
685 aa  182  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.98 
 
 
693 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.85 
 
 
815 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  32 
 
 
693 aa  182  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.29 
 
 
696 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.85 
 
 
818 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.1 
 
 
818 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.52 
 
 
686 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.77 
 
 
790 aa  181  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2072  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.67 
 
 
696 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.77 
 
 
695 aa  180  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.37 
 
 
694 aa  180  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.83 
 
 
701 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.27 
 
 
846 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.35 
 
 
702 aa  179  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0852  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.03 
 
 
614 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 
701 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.77 
 
 
673 aa  179  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.02 
 
 
706 aa  179  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.27 
 
 
706 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.87 
 
 
678 aa  178  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.98 
 
 
818 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  30.58 
 
 
700 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.85 
 
 
701 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.95 
 
 
704 aa  177  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.55 
 
 
685 aa  177  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.16 
 
 
698 aa  176  8e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.71 
 
 
819 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.11 
 
 
908 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.48 
 
 
706 aa  176  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.78 
 
 
805 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.32 
 
 
799 aa  176  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.08 
 
 
682 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.95 
 
 
682 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.27 
 
 
846 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.66 
 
 
695 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.48 
 
 
706 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.17 
 
 
682 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.43 
 
 
693 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.17 
 
 
682 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.17 
 
 
691 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.67 
 
 
682 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.04 
 
 
686 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  35.05 
 
 
685 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.05 
 
 
781 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.04 
 
 
686 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.22 
 
 
695 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.17 
 
 
682 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.17 
 
 
657 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.39 
 
 
704 aa  175  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.17 
 
 
682 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.17 
 
 
682 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.12 
 
 
715 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.45 
 
 
819 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.39 
 
 
704 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.75 
 
 
747 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.32 
 
 
717 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>