More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3565 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
345 aa  696    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  80 
 
 
345 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 
345 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  47.94 
 
 
344 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.09 
 
 
348 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  47.25 
 
 
343 aa  298  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.35 
 
 
343 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
352 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.8 
 
 
345 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.71 
 
 
352 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.35 
 
 
343 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.71 
 
 
347 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 
352 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.24 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
358 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.09 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  43.57 
 
 
350 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  44.35 
 
 
343 aa  279  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  45.53 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  45.8 
 
 
342 aa  269  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  42.69 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  43.8 
 
 
347 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  40.41 
 
 
344 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.07 
 
 
344 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.44 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
345 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.77 
 
 
349 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 
343 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 
343 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 
343 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  37.21 
 
 
343 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  37.21 
 
 
343 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  37.21 
 
 
343 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  37.21 
 
 
343 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.21 
 
 
343 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  37.21 
 
 
343 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  37.21 
 
 
343 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  39.23 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.16 
 
 
349 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.37 
 
 
342 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.49 
 
 
345 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.52 
 
 
342 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.85 
 
 
344 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  40.06 
 
 
345 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.41 
 
 
340 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.24 
 
 
368 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.62 
 
 
346 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.9 
 
 
359 aa  198  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.3 
 
 
352 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  36.59 
 
 
342 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  35.26 
 
 
379 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  31.16 
 
 
348 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
344 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  35.84 
 
 
359 aa  188  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.93 
 
 
341 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
355 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
341 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
341 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.59 
 
 
345 aa  182  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.26 
 
 
352 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
348 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.53 
 
 
333 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  38.06 
 
 
363 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.05 
 
 
373 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  36.41 
 
 
352 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
373 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  37.5 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
373 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  36.68 
 
 
373 aa  172  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  34.46 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.54 
 
 
347 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.55 
 
 
347 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.38 
 
 
349 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  34.95 
 
 
350 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
373 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 
364 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 
351 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  37.74 
 
 
336 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
354 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  35.56 
 
 
360 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.39 
 
 
354 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
365 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.61 
 
 
350 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.61 
 
 
350 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
347 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.38 
 
 
373 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.33 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.33 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.33 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  33.33 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.83 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.96 
 
 
360 aa  165  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.05 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>