More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0886 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0886  inner-membrane translocator  100 
 
 		 331 aa  636    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689512  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4185  Monosaccharide-transporting ATPase  83.39 
 
 		 342 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3429  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00479151  hitchhiker  0.0000975841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0888  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.06 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4187  Monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837303  hitchhiker  0.00079828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  32.76 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  32.42 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  32.42 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  32.08 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  30.09 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  31.4 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  31.4 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  29.76 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  31.4 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.49 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  35.67 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  35.67 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  30.7 
 
 		 326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  30.62 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.11 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  30.7 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  30 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  30.62 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  30.62 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  30.62 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  30.85 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  30.85 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  34.89 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.85 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  33.85 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  33.85 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.44 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  30.51 
 
 		 311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  31.36 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  30.94 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  30.94 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.95 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  30.94 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  33.85 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  30.94 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  33.93 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  33.93 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  29.87 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.94 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  33.86 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  30.51 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  30.51 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.19 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.49 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  33.77 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  30.94 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  30.84 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>