218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0361 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0361  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  364  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  58.82 
 
 
199 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  58.29 
 
 
199 aa  213  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  58.96 
 
 
199 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  56.68 
 
 
199 aa  191  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4234  hypothetical protein  55.96 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744826  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  55.03 
 
 
203 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0594  lysine exporter protein LysE/YggA  53.72 
 
 
200 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3541  hypothetical protein  55.08 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000708449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  42.7 
 
 
212 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  37.3 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 
197 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.35 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.89 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
199 aa  84.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.38 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.89 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  34.78 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  28.19 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.63 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  27.93 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  27.03 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  25.41 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.16 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1235  lysine exporter protein LysE/YggA  27.41 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0243337  normal  0.0393722 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  28.19 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  28.19 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  30.6 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  28.19 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  28.19 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  25.54 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  30.6 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  30.6 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  30.6 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  30.6 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  30.6 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  28.19 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  25.54 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  25.54 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  27.81 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  28.19 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  28.96 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  27.72 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  30 
 
 
280 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  25 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  29.83 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  29.12 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2755  neutral amino-acid efflux protein  31.55 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0462537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2861  neutral amino-acid efflux protein  31.55 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2839  neutral amino-acid efflux protein  31.55 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  25.27 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2857  neutral amino-acid efflux protein  31.55 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.719199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  25.14 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  30.32 
 
 
640 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  35.34 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2973  neutral amino-acid efflux protein  31.02 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.69 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  30.56 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  25 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1055  hypothetical protein  28.19 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  28.9 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  29.26 
 
 
195 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  24.6 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3106  hypothetical protein  28.88 
 
 
196 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  30.97 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  26.92 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  27.17 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  32.87 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>