More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6268 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  100 
 
 		 372 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  71.82 
 
 		 370 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1314  ABC transporter related  65.04 
 
 		 373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.94 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.75 
 
 		 370 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.94 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.94 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.27 
 
 		 381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  51.37 
 
 		 372 aa  355  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  50.54 
 
 		 366 aa  355  7.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52.52 
 
 		 402 aa  355  8.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.75 
 
 		 384 aa  349  6e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  49.73 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  49.31 
 
 		 363 aa  348  9e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.59 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.03 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 		 369 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.8 
 
 		 372 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.07 
 
 		 352 aa  345  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  51.64 
 
 		 374 aa  345  7e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  52.05 
 
 		 385 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  53.56 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  51.21 
 
 		 374 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.13 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  49.06 
 
 		 366 aa  342  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  50.4 
 
 		 376 aa  342  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.82 
 
 		 369 aa  342  9e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.89 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 366 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.84 
 
 		 378 aa  338  5.9999999999999996e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 		 366 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  53.51 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  48.3 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.38 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 364 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.65 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  46.88 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  52.97 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.55 
 
 		 357 aa  335  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  47.31 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  51.23 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  50.13 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 		 371 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  49.46 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 370 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  51.67 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  49.6 
 
 		 369 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  48.77 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  48.12 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.27 
 
 		 370 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  49.86 
 
 		 380 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  52.57 
 
 		 362 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48 
 
 		 364 aa  332  9e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.96 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.71 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  49.46 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1816  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  50 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  49.3 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  49.03 
 
 		 366 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  46.76 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  49.46 
 
 		 363 aa  328  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  52.58 
 
 		 366 aa  328  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  49.05 
 
 		 363 aa  328  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.82 
 
 		 360 aa  328  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  50.55 
 
 		 360 aa  328  9e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  50.27 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  50.14 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  50.27 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 367 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.09 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.27 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  50.14 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  49.72 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.41 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  48.1 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.5 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  51.66 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>