More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2526 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  50.9 
 
 		 667 aa  643    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  50.15 
 
 		 660 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  67.49 
 
 		 654 aa  947    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 657 aa  679    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 		 664 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  75.15 
 
 		 660 aa  1038    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  72.91 
 
 		 660 aa  1016    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 		 657 aa  682    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  73.3 
 
 		 633 aa  986    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6251  acetate/CoA ligase  98.78 
 
 		 664 aa  1343    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  72.56 
 
 		 660 aa  1018    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  72.56 
 
 		 660 aa  1018    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  52.88 
 
 		 657 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  68.89 
 
 		 654 aa  946    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  73.67 
 
 		 664 aa  1025    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53 
 
 		 658 aa  705    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  75.15 
 
 		 660 aa  1054    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  68.04 
 
 		 655 aa  902    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.2 
 
 		 658 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  52.5 
 
 		 657 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  72.56 
 
 		 660 aa  1018    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  59.15 
 
 		 657 aa  781    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  52.21 
 
 		 643 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  52.04 
 
 		 680 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  74.09 
 
 		 660 aa  1001    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  73.93 
 
 		 660 aa  1021    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  50.83 
 
 		 652 aa  659    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.75 
 
 		 673 aa  718    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 		 666 aa  638    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.75 
 
 		 657 aa  707    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  51.96 
 
 		 651 aa  637    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  62.18 
 
 		 653 aa  817    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  52.99 
 
 		 651 aa  706    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50.97 
 
 		 660 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.15 
 
 		 656 aa  725    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  62.8 
 
 		 650 aa  829    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  72.71 
 
 		 660 aa  1018    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  73.55 
 
 		 680 aa  1005    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  51.96 
 
 		 674 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  74.09 
 
 		 660 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  81.17 
 
 		 664 aa  1150    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1067  acetyl-coenzyme A synthetase  84.19 
 
 		 665 aa  1190    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0785077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  72.56 
 
 		 660 aa  1018    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  81 
 
 		 665 aa  1155    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  74.39 
 
 		 660 aa  1016    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  74.58 
 
 		 660 aa  1044    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  65.65 
 
 		 654 aa  893    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  80.69 
 
 		 665 aa  1130    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  68.31 
 
 		 658 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  72.91 
 
 		 660 aa  1016    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 		 657 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  69.56 
 
 		 658 aa  946    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  59.27 
 
 		 652 aa  766    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  51.81 
 
 		 657 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  49.4 
 
 		 660 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  72.56 
 
 		 660 aa  1018    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  75.46 
 
 		 660 aa  1063    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.52 
 
 		 652 aa  706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.27 
 
 		 655 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  74.73 
 
 		 660 aa  1046    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.22 
 
 		 660 aa  669    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  73.53 
 
 		 664 aa  1026    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  74.24 
 
 		 660 aa  1026    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  81.83 
 
 		 666 aa  1165    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  73.38 
 
 		 664 aa  1025    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  52.7 
 
 		 658 aa  697    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  70.62 
 
 		 657 aa  1001    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.36 
 
 		 649 aa  656    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.21 
 
 		 655 aa  679    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2526  acetate/CoA ligase  100 
 
 		 666 aa  1370    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5367  acetate/CoA ligase  74.29 
 
 		 655 aa  987    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  71.08 
 
 		 658 aa  983    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  72.3 
 
 		 660 aa  1021    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53.4 
 
 		 655 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  74.28 
 
 		 660 aa  1023    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  73.52 
 
 		 664 aa  1023    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  54.32 
 
 		 655 aa  711    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  70.86 
 
 		 634 aa  957    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  72.56 
 
 		 660 aa  1018    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  70.9 
 
 		 660 aa  947    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  74.24 
 
 		 660 aa  1026    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  73.53 
 
 		 664 aa  1026    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  72.56 
 
 		 660 aa  1018    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  51.52 
 
 		 649 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 		 657 aa  683    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.12 
 
 		 656 aa  684    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  54.45 
 
 		 648 aa  716    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.68 
 
 		 658 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  54.32 
 
 		 655 aa  711    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  52.16 
 
 		 658 aa  650    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 		 664 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  51.84 
 
 		 650 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  84.34 
 
 		 665 aa  1192    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.07 
 
 		 660 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  51.82 
 
 		 664 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  54.01 
 
 		 648 aa  672    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  85.39 
 
 		 664 aa  1197    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  79.34 
 
 		 664 aa  1116    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03257  acetyl-CoA synthetase  51.53 
 
 		 647 aa  632  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  49.7 
 
 		 667 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>