34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2117 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 519 aa  1043    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  48.18 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  46.84 
 
 		 492 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  45.17 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  45.76 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  44.79 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  42.97 
 
 		 517 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.57 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  41.06 
 
 		 524 aa  340  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  36.69 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  35.77 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  35.02 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  36.64 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  35.96 
 
 		 481 aa  243  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  30.77 
 
 		 510 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 475 aa  223  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  33.94 
 
 		 475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.47 
 
 		 488 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  30.51 
 
 		 501 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.94 
 
 		 477 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  31.6 
 
 		 484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  29.53 
 
 		 238 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2411  hypothetical protein  70.27 
 
 		 70 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  23.87 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  24.55 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.46 
 
 		 236 aa  50.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  27.17 
 
 		 251 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  24.89 
 
 		 235 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.55 
 
 		 359 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  26.11 
 
 		 245 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  23.17 
 
 		 241 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.62 
 
 		 258 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>