More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0865 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  84.97 
 
 		 305 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  84.31 
 
 		 305 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  83.66 
 
 		 305 aa  527  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  83.01 
 
 		 305 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  79.34 
 
 		 307 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  82.68 
 
 		 321 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  78.43 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  79.74 
 
 		 305 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  79.74 
 
 		 305 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  78.36 
 
 		 305 aa  474  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  75.82 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  74.84 
 
 		 305 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  73.44 
 
 		 305 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  73.44 
 
 		 305 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  69.31 
 
 		 302 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  59.47 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  60.2 
 
 		 302 aa  368  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  55.15 
 
 		 312 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  53.49 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  57.81 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  50.84 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  50.84 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  49.83 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  56.15 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  51 
 
 		 302 aa  292  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  48.5 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.25 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  54.03 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 321 aa  285  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  50.83 
 
 		 301 aa  285  8e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  53.2 
 
 		 307 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  52.82 
 
 		 307 aa  285  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  52.96 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  51.49 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  55.78 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  52 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  53.54 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  50.5 
 
 		 311 aa  281  7.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  53.64 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  49.01 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  53.49 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  53.2 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  53.2 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  53.2 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  53.2 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  53.27 
 
 		 317 aa  278  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  53.2 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  53.2 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  53.51 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  53.51 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  52.94 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  49.35 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  53.2 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  53.51 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  54 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  54 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.15 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  52.32 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  52.53 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51.34 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  52.81 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  52.49 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  52.53 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  51.01 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  53.8 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  53.67 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  51.16 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  57.04 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.17 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  53.16 
 
 		 308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  52.35 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  49.83 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  53.64 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  52.13 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  53 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  52.15 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  52.15 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  55.03 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  51.82 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  50.34 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  51.82 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  53.59 
 
 		 313 aa  269  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  50.65 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  54.52 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  51.82 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  51.49 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  52.48 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  52.63 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  50.34 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  51.96 
 
 		 319 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  48.84 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  50.81 
 
 		 316 aa  266  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  51.14 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>