48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1449 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  684    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  46.31 
 
 		 158 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  46.71 
 
 		 154 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  45.64 
 
 		 150 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  93.2  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  37.24 
 
 		 152 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  31.94 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  36.55 
 
 		 155 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  34.25 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  33.33 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  30.37 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1124  hypothetical protein  34.64 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  26.53 
 
 		 185 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02273  hypothetical protein  34.13 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003498  hypothetical protein  34.67 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  31.82 
 
 		 230 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  27.19 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  29.09 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  30.19 
 
 		 186 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  24.81 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  35.24 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  29.09 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  29.09 
 
 		 227 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  27.07 
 
 		 193 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  29.82 
 
 		 238 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  29.36 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  28 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  31.03 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  28.43 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  29.08 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  29.45 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  30.97 
 
 		 243 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  26.38 
 
 		 186 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  29.45 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  26.78 
 
 		 197 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  34.31 
 
 		 203 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  27.56 
 
 		 222 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>