21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2796 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  98.96 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  63.84 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  62.15 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  61.88 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  60.23 
 
 		 176 aa  217  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  56.79 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  55.56 
 
 		 170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  53.33 
 
 		 175 aa  170  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  52.73 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  51.85 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  54.72 
 
 		 166 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  49.37 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  40.24 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  46.15 
 
 		 155 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  34.58 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  45.1 
 
 		 75 aa  48.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  24.24 
 
 		 335 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  29.22 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  27.19 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  27.15 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>