35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3714 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  314  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  46.15 
 
 
193 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  46.15 
 
 
193 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  43.36 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  42.07 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  40.56 
 
 
189 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  37.76 
 
 
190 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  41.38 
 
 
175 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  40.14 
 
 
173 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  40.14 
 
 
166 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  32.75 
 
 
177 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  35.66 
 
 
176 aa  97.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  38.03 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  35.62 
 
 
185 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  32.89 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  37.24 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5274  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  32.47 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00877688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  38.78 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3083  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.87 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  46.55 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5495  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  27.74 
 
 
172 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3199  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  32.47 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172703  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0385  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.87 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0193499  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0453  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.68 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0417  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.22 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3122  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.3 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0516207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2445  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.77 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  28 
 
 
335 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  24.32 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  28.78 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  27.93 
 
 
154 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  24.64 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  25.52 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  26.67 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  28.1 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>