30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2766 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  362  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  76.51 
 
 		 170 aa  261  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  62.36 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  64.12 
 
 		 175 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  64.46 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  57.41 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  56.79 
 
 		 193 aa  191  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  57.93 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  55.19 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  51.88 
 
 		 190 aa  170  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  52.38 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  53.12 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  48.68 
 
 		 176 aa  151  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  43.35 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  43.36 
 
 		 155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  55.1 
 
 		 75 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  32.19 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5274  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00877688  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  28.74 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  31.33 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  27.4 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  28.19 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3122  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0516207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  25.34 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3083  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.67 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  25.34 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0385  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.45 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0193499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  26.03 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  27.4 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  24.67 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>