28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1125 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  330  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  59.72 
 
 		 154 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  58.45 
 
 		 150 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  46.31 
 
 		 335 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  47.75 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  34.48 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  33.55 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  36.17 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  33.79 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  32.17 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  34.27 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  32.86 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  34.07 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  31.85 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  31.85 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  29.1 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  28.74 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  28.68 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  26.98 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  24.32 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  30.16 
 
 		 166 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  31.31 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>