21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0054 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  330  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  84.31 
 
 		 156 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  82.35 
 
 		 156 aa  276  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  81.88 
 
 		 155 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  78.52 
 
 		 155 aa  255  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  75 
 
 		 154 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  74.34 
 
 		 154 aa  246  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  74.34 
 
 		 154 aa  246  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  73.03 
 
 		 154 aa  245  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  73.03 
 
 		 154 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  73.03 
 
 		 154 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  73.03 
 
 		 154 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  73.03 
 
 		 154 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  72.37 
 
 		 154 aa  243  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  76.76 
 
 		 152 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  37.32 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  38.73 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  35.37 
 
 		 335 aa  80.5  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  32.17 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  45.16 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  27.4 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>