20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3715 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  323  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  323  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  98.7 
 
 		 154 aa  319  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  96.75 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  90.26 
 
 		 154 aa  298  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  89.61 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  89.61 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  89.61 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  89.61 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  77.85 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  77.18 
 
 		 155 aa  254  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  75.17 
 
 		 156 aa  254  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  74.34 
 
 		 156 aa  246  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  69.39 
 
 		 155 aa  234  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  74.65 
 
 		 152 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  39.57 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  38.17 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  31.76 
 
 		 335 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  31.34 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  31.85 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>