22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4142 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  82.12 
 
 
156 aa  276  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  82.67 
 
 
156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  81.88 
 
 
156 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  77.18 
 
 
154 aa  254  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  77.18 
 
 
154 aa  254  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  77.18 
 
 
154 aa  254  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  76.51 
 
 
154 aa  253  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  76.51 
 
 
154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  76.51 
 
 
154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  76.51 
 
 
154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  76.51 
 
 
154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  75.84 
 
 
154 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  73.68 
 
 
155 aa  249  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  73.94 
 
 
152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  39.44 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  35.21 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  34.48 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  36.81 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  37.6 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  25.34 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  28.4 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>