26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02272 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  315  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  87.01 
 
 
154 aa  282  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  58.45 
 
 
158 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  45.64 
 
 
335 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  55.56 
 
 
143 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  37.32 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  37.09 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  35.21 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  36.42 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  36.62 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  37.96 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  37.23 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  37.23 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  37.23 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  37.23 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  38.93 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  35.56 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  38.17 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  38.17 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  38.17 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  25.9 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  28.7 
 
 
214 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2445  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.55 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  25.81 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  25.52 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3122  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  27.15 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0516207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>