27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0397 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  438  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3122  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.94 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0516207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5274  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  35.21 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00877688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3083  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  34.51 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5495  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  35.42 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0453  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.8 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.469559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3199  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.06 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  37.24 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0385  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.1 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0193499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0417  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  33.1 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2445  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  32.64 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0500  hypothetical protein  32.87 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  32.19 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  30.87 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  29.73 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  28.7 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  30.34 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  28.28 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  29.73 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  29.8 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  29.05 
 
 		 175 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  32.41 
 
 		 180 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  26.21 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  28.97 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  27.89 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  29.7 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  27.7 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>