25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0830 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  84.3 
 
 		 190 aa  298  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  63.79 
 
 		 189 aa  238  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  65.71 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  60.12 
 
 		 193 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  60.12 
 
 		 193 aa  207  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  52.26 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  48.68 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  50.63 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  48.75 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  50.66 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  46.05 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  47.1 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  35.5 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  35.66 
 
 		 155 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  30.87 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5274  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  27.15 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00877688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3199  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  24.5 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  38.98 
 
 		 75 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0385  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  23.84 
 
 		 172 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0193499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3083  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  23.49 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0417  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  23.84 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3122  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.06 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0516207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  25.81 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>