25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1164 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  333  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3730  hypothetical protein  68.55 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.485732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  57.93 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0677  hypothetical protein  55.42 
 
 		 170 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2591  hypothetical protein  55.62 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2187  hypothetical protein  55.62 
 
 		 175 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.283277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3469  hypothetical protein  55.35 
 
 		 193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0683999  normal  0.332053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2378  hypothetical protein  53.37 
 
 		 173 aa  163  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.316906  hitchhiker  0.00324928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2796  hypothetical protein  54.72 
 
 		 193 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.984911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  52.8 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0932  hypothetical protein  50.31 
 
 		 190 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4067  hypothetical protein  51.92 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0830  hypothetical protein  50.66 
 
 		 176 aa  147  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1402  hypothetical protein  37.43 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  40.14 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0562  hypothetical protein  45.9 
 
 		 75 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  28.28 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  32.97 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1281  hypothetical protein  33.01 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.738603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  31.03 
 
 		 335 aa  45.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3122  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  31.87 
 
 		 172 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0516207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  30.16 
 
 		 158 aa  42  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  28.09 
 
 		 152 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5274  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  32.65 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00877688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>