23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4426 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  329  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  87.01 
 
 		 156 aa  299  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  84.31 
 
 		 156 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  82.12 
 
 		 155 aa  276  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  77.85 
 
 		 154 aa  256  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  78.52 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  77.85 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  77.85 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  78.52 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  78.52 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  78.52 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  76.51 
 
 		 154 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  76.82 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  77.18 
 
 		 154 aa  253  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  80.28 
 
 		 152 aa  249  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  39.47 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  36.42 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  33.1 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  39.06 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  33.79 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  28.19 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143134  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>