21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0342 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  322  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  91.56 
 
 
154 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  90.91 
 
 
154 aa  299  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  90.26 
 
 
154 aa  298  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  90.26 
 
 
154 aa  298  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  85.71 
 
 
154 aa  286  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  85.71 
 
 
154 aa  286  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  85.71 
 
 
154 aa  286  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  85.71 
 
 
154 aa  286  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  77.18 
 
 
156 aa  253  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  73.83 
 
 
156 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  75.84 
 
 
155 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  72.37 
 
 
156 aa  243  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  71.14 
 
 
155 aa  240  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  73.24 
 
 
152 aa  228  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  39.31 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  37.96 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  35.07 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  32.43 
 
 
335 aa  73.9  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  32.86 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2766  hypothetical protein  26.03 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>